Informator o studiach


UNIWERSYTET WARSZAWSKI

U.W. Wydział Chemii, ul. Pasteura 1, 02-093 Warszawa



Nazwa przedmiotu

Teoria struktury cząsteczek o znaczeniu biologicznym


Nr / kod przedmiotu*


Semestr

IX

Rodzaj zajęć

Wykład monograficzny


Liczba godzin
Na semestr      Na tydzień
15 / 1

Liczba punktów

1


Prowadzący:

Prof. dr hab. Andrzej Leś
Pokój: 535     Tel: w. 201      e-mail: ales@chem.uw.edu.pl

Zakład dydaktyczny:

Zakład Chemii Teoretycznej i Krystalografii

Efekty kształcenia
i kompetencje:

Zdobycie wiadomości na temat współczesnych metod teoretycznego opisu struktury i właściwości cząsteczek chemicznych o znaczeniu biologicznym.

Opis przedmiotu:

W trakcie wykładu omówione zostaną następujące zagadnienia:

1) Pojęcie cząsteczki biologicznie aktywnej (biocząsteczki); przykłady teoretycznych obliczeń struktury składników kwasów nukleinowych, enzymów i błon biologicznych.
2) Popularne bazy danych strukturalnych (RCSB) i sekwencyjnych (EMBL, Entrez).
3) Teorie kwantowe (Hartree-Fock, post-Hartree-Fock, DFT, półempiryczne) w wersjach umożliwiających badania biocząsteczek.
4) Teorie statystyczne. Monte Carlo, Dynamika Molekularna, Dynamika Langevina, Metoda Car-Parrinello.
5) Powiązanie aktywności biologicznej ze strukturą chemiczną. Dokowanie. Algorytmy wykorzystujące szybką transformację Fouriera, molekularne potencjały elektrostatyczne. Korelacja struktura-aktywność (QSAR) i rozpoznawanie struktury metodami sztucznej inteligencji.
6) Teorie kinetyczne.

Wymagane podstawy:

Wykład z ,,Chemii kwantowej A", pożądana jest znajomość metod numerycznych i statystycznych wykorzystywanych w chemii oraz znajomość podstaw programowania komputerów.

Forma zaliczenia:

samodzielnie wykonane zadanie domowe oraz sprawdzian wiadomości
Zaliczenie na ocenę

Uwagi:

-



Nadzór redakcyjny: Jadwiga Skupińska

Stronę oprac. Adam Myśliński